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免疫组化分析法色彩分割机器学习

  • 来源:本站原创
  • 时间:2020/10/15 9:07:09
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聊点学术

免疫组化定量分析是科研人的传统艺能!之前,个人一直推荐采用ImageProPlus(IPP)进行测量。IPP测量时对染色效果要求较高。其原理是在HSI模式下,通过参数设定或调节直方图波形曲线的方法来选定阳性表达区。详情见→既往精彩原创汇总当背景染色较强或者细胞核较多时,上述方法操作起来比较费力。

(背景染色太深)

(细胞核多)

今天要说的是基于ImageJ的“色彩分割法和机器学习”进行免疫组化定量分析。关键插件为IHCToolbox,由英国诺丁汉大学的两位大牛开发。原理1:自动化将棕色(DAB)和蓝色(苏木素)色彩分割,这样就可以直接快捷地测量阳性区。原理2:机器学习模式帮助imageJ精准识别阳性表达物(棕色)图文教程1.下载安装FiJi版本imageJ,接下来要用到其中的插件IHCToolbox,否则无法进行后续操作。(imageJ开源软件下载


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